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環(huán)境微生物中的定量PCR

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環(huán)境(如土壤、糞便及水環(huán)境等)微生物種屬多樣性以及功能基因差異是目前農(nóng)學(xué)和醫(yī)學(xué)研究的熱點(diǎn)之一。通過16s rRNA可變區(qū)的高通量測序,一定程度上對環(huán)境中的微生物進(jìn)行了屬的鑒定。但對環(huán)境中的功能基因無法進(jìn)行鑒定分析,目前還只能靠定量PCR方法進(jìn)行檢測。

基本流程

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技術(shù)優(yōu)勢

(1)?????? 本公司擁有多種微生物(如:總細(xì)菌、芽孢桿菌、氨氧化細(xì)菌等)檢測的質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品,而且這些標(biāo)準(zhǔn)品擴(kuò)增效率高,特異性強(qiáng),方便的用于后續(xù)的細(xì)菌種屬的qPCR絕對定量分析。

(2)?????? 本公司構(gòu)建了多種微生物的功能基因(如:nirSnirK以及nosZ等)質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品,這些標(biāo)準(zhǔn)品擴(kuò)增效率高,標(biāo)準(zhǔn)曲線相關(guān)系數(shù)(R2)均在0.98以上。

客戶須知:

環(huán)境微生物中的定量PCR

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周期

最終提供客戶資料

環(huán)境微生物中的定量PCR

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20-30個工作日(視樣品和基因數(shù)目而定

詳細(xì)實驗總結(jié)報告(包括基因組DNA提取、質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品制備過程及測序、標(biāo)準(zhǔn)品和未知樣品擴(kuò)增曲線、標(biāo)準(zhǔn)曲線、熔點(diǎn)曲線、相對表達(dá)分析結(jié)果,統(tǒng)計分析等)

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案例:

本實驗對土壤中反硝化細(xì)菌中的關(guān)鍵功能基因亞硝酸鹽還原酶(nirK,nirS)和一氧化氮還原酶(nosZ)基因進(jìn)行絕對定量分析,從而探討了氮相關(guān)功能微生物群落豐度與環(huán)境因子的關(guān)系。本實驗中的質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品全部來自于本公司構(gòu)建并測序,特異性和靈敏度較高。

?? 不同土壤樣品中nirS、nirKnosZ基因擴(kuò)增的標(biāo)準(zhǔn)曲線和擴(kuò)增曲線

客戶提供:

樣品類型

土壤和糞便樣本

水環(huán)境樣本

樣品需要量

500 mg

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5ml

取樣和保存環(huán)境

無菌管收集,最好保存在-20℃或-80

無菌管收集、離心,最好保存在-20℃或-80

運(yùn)輸

杭州市內(nèi)干冰上門取樣;

外地客戶干冰快遞運(yùn)輸;

組織保存液,冰袋運(yùn)輸

杭州市內(nèi)干冰上門取樣;

外地客戶干冰快遞運(yùn)輸;

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*(經(jīng)本公司評估后,實驗沒有結(jié)果,不收取任何費(fèi)用)

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